A HBOT kezeléseket szigorú biztonsági intézkedések kísérik, a pácienseket szakképzett személyzet segíti.
Ők a kamrán kívül folyamatosan figyelemmel kísérik a bent tartózkodók állapotát, akikkel mikrofon segítségével kommunikálnak. Ez egyrészt lehetővé teszi, hogy a pácienseknek pontos instrukciókat adjanak az eljárás ideje alatt, másrészt pedig a kezelésen részt vevők azonnal jelezni tudják, ha kérésük, kérdésük van. A személyzet minden kamra indítás előtt és után ellenőrzi a berendezést, az esetlegesen felmerülő gondok (például áramszünet) megoldására előre kidolgozott terv alapján azonnal reagál.
A pácienseket a kamrában kényelmes fotelek, olvasási és tévénézési lehetőség várja. A 98%-os tisztaságú oxigént orrkanül segítségével lélegzik be.
Az eljárás lassú nyomásnövekedéssel kezdődik. Eközben zúgó hang hallatszik. Csak a középfülben érzékelhető a nyomásváltozás, a szervezet többi része nem tapasztal eltérést. Mivel a középfülben tapasztalt nyomásváltozás kiegyenlítése a kezelés elején elengedhetetlen, erre fokozottan odafigyelünk.
A terápiához szükséges nyomást lassan, negyed óra alatt érjük el. 50-100 kPa, vagy egyszerűbben 5-10 méter vízmélységnek megfelelő nyomás elérése után már nincs szükség a középfül nyomás kiegyenlítésére. A színtelen, szagtalan, íztelen tiszta oxigén áramoltatását az orrkanülben, már a kamrába üléskor megkezdjük. Ajánlott az orron keresztül lélegezni, A légzés nem nehezebb, mint máskor, a megszokott módon, erőlködés nélkül végezhető.
Ha a kezelés alatt, még annak befejezése előtt valamilyen gond, rosszullét merülne fel, a személyzet azonnal csökkenteni kezdi a nyomást a helyiségben, és amint lehet, kinyitja az ajtót.
Normál esetben a kezelési idő elteltével kezdődik meg a nyomás lassú csökkentése, ilyenkor ismét zúgó hang hallatszik. A nyomásváltozás hatására a fül újra bedugulhat, így a nyomáskiegyenlítésre ekkor is szükség lehet. A terápia után haza lehet menni. Fáradtságot, álmosságot érzékelhetünk, ami teljesen normális.